Après l'issue dramatique du plan E en Alaska. Satellizer et ses amis sont de retour à West Genetics. Mais sans Shiffon et Elisabeth, l'ambiance s'est quelque peu détériorée. Les Pandora de l'académie apprennent alors l'existence du "projet Valkyrie", dirigé par Aoï Gengo, et destiné à renforcer le dispositif défensif anti-Nova...